Le nettoyage du Thermomix® après la cuisson est très simple. S'il y a des résidus alimentaires à l'intérieur du bol, versez un peu d'eau dans le bol avec une ou deux gouttes de détergent, puis mettez le thermostat en marche au niveau 10 pendant quelques secondes. Cela permettra d'éliminer la plupart des résidus d'ingrédients dans le bol et le couvercle. Si un nettoyage plus profond est nécessaire, le bol peut être démonté et mis au lave-vaisselle ou lavé à la main. Toutes les parties individuelles du bol peuvent être mises au lave-vaisselle. L'unité de base Thermomix® peut être essuyée avec un chiffon humide et un nettoyant doux.